本片讲述了狄仁杰在一片乱局一种受命调查通天教主奇案，一路上历经艰险，凭借聪明才智破解了真相，救出了被绑架的武则天，并拆穿通天教主的真身，挽留了国家于为难的故事。。一个单身母亲卷入致命罪行后，她的天才数学教师邻居伸出援手，而一名执着的警察也开始深入调查此案。
